La historia de «Las Aventuras de Génesis Zero» sigue a Kuro, un sicario letal e invisible que oculta su rostro tras una máscara Oni de ébano y viste gabardina con guantes marcados con runas sagradas. Operando en un submundo urbano decadente y lluvioso, Kuro acepta un contrato mortal para eliminar a "El Santo", un líder atrincherado en una antigua catedral abandonada. Tras cumplir su misión con precisión quirúrgica, su camino da un giro radical al ser enviado en exilio clandestino hacia los muelles de Tailandia. Allí, tras desmantelar una red criminal y rescatar a una misteriosa joven encerrada en una jaula, descubre que ella no es una simple rehén, sino una "llave" biológica vital que resguarda los planos secretos de una red oculta. Perseguido por su propio cliente y por fuerzas tácticas del Círculo, Kuro desciende hacia las entrañas de su propio pasado al regresar al Santuario, una base subterránea abandonada. En este mausoleo tecnológico guiado por la inteligencia artificial Aethelgard, Kuro comprende que él mismo fue el arquitecto original de un protocolo de extinción, viéndose obligado a desentrañar los secretos de su memoria fragmentada mientras el mundo colapsa a su alrededor en una guerra interdimensional y cibernética.